Perbezaan Utama - Genomik vs Proteomik

Genomik, proteomik, dan metabolisme adalah bidang yang terlibat dalam kajian dan klasifikasi makhluk hidup dengan cara genomnya, produk protein yang disintesis berdasarkan petunjuk genetik, dan jenis molekul yang dimetabolismekan masing-masing. Genomik dan proteomik adalah bidang yang berkait rapat. The perbezaan utama antara genomik dan proteomik adalah bahawa genomik adalah kajian keseluruhan kumpulan gen dalam genom sel sedangkan proteomik adalah kajian keseluruhan kumpulan protein yang dihasilkan oleh sel. Metabolomik, sebaliknya, adalah kajian keseluruhan set sebatian berat molekul rendah yang berfungsi sebagai substrat dan produk sampingan reaksi enzimatik sel.

Kawasan Utama Dilindungi

1. Apa itu Genomik - Definisi, Teknik, Klasifikasi 2. Apa itu Proteomik - Definisi, Teknik, Klasifikasi 3. Apakah Persamaan Antara Genomik dan Proteomik - Garis Besar Ciri Umum 4. Apakah Perbezaan Antara Genomik dan Proteomik - Perbandingan Perbezaan Utama

Syarat Utama: Gen, Genomik, Projek Genom Manusia (HGP), Projek Proteome Manusia (HPP), Protein, Proteome, Proteomik

Apa itu Genomik

Genomik merujuk kepada kajian keseluruhan kumpulan gen dalam genom. Genom adalah set lengkap maklumat genetik organisma, terutama terdiri dari DNA. Teknik throughput tinggi digunakan dalam genomik untuk memetakan, mengurutkan, dan menganalisis genom. Teknik yang terlibat dalam genomik merangkumi strategi penjujukan gen seperti penjujukan gen yang diarahkan, penjujukan urutan senapang genom keseluruhan, pembinaan teg urutan yang dinyatakan (EST), pengenalpastian polimorfisme nukleotida tunggal (SNP), dan analisis dan tafsiran data yang diurutkan menggunakan perisian yang berbeza dan pangkalan data. Langkah-langkah utama penjujukan senapang ditunjukkan pada gambar 1.

Gambar 1: Penjujukan Senapan Alam Sekitar (ESS)Persampelan, (B) Menapis Zarah, (C) Pengekstrakan dan Lisis DNA, (D) Pengklonan dan Perpustakaan, (D) Urutan, (E) Perhimpunan Urutan

Dua bidang utama genomik adalah genomik struktur dan genomik berfungsi. Dalam genomik struktur, struktur dan kedudukan relatif gen dikaji semasa di genomik berfungsi, fungsi atau peranan gen dalam mengatur aktiviti metabolik dikaji. Projek Penjujukan Genom adalah perkembangan terbaru dalam genomik. Projek Genom Manusia (HGP) selesai pada tahun 2003. Matlamat Projek Genom Manusia adalah:

Selain genom manusia, genom tikus dan padi juga telah menjalani kajian genom.

Apa itu Proteomik

Proteomics merujuk kepada kajian keseluruhan kumpulan protein yang dihasilkan oleh sel. Proteome adalah set lengkap protein yang dihasilkan oleh sel. Dalam proteomik, pencirian struktur 3D dan fungsi protein dilakukan dengan menggunakan kaedah throughput tinggi. Teknik yang terlibat dalam proteomik termasuk pengekstrakan dan pemisahan elektroforetik protein, pencernaan protein dengan penggunaan trypsin menjadi serpihan kecil, penentuan urutan asid amino dengan spektrometri massa, dan pengenalpastian protein menggunakan maklumat dalam pangkalan data protein. Lebih-lebih lagi, struktur 3D protein dapat diramalkan menggunakan kaedah berasaskan perisian. Ekspresi protein dapat dikaji oleh protein mikroarray. Peta rangkaian protein dapat dikembangkan untuk menentukan interaksi protein-protein. Fenomena proteomik yang berbeza ditunjukkan dalam gambar 2.

Gambar 2: Proteomik

Produk protein gen genom manusia dikaji semasa Projek Human Proteome (HPP). Salah satu tujuan utama Projek Proteome Manusia adalah untuk mengenal pasti protein yang terlibat dalam penyakit utama.

Persamaan Antara Genomik dan Proteomik

Perbezaan Antara Genomik dan Proteomik

Definisi

Genomik: Genomik merujuk kepada kajian keseluruhan kumpulan gen dalam genom.

Proteomik: Proteomics merujuk kepada kajian keseluruhan kumpulan protein yang dihasilkan oleh sel.

Fenomena

Genomik: Genomik melibatkan pemetaan, penjujukan, dan analisis genom.

Proteomik: Proteomik melibatkan struktur dan fungsi 3D protein, dan interaksi protein-protein.

Pengelasan

Genomik: Dua jenis genomik adalah genomik struktur dan genomik berfungsi.

Proteomik: Tiga jenis proteomik adalah proteomik struktur, fungsional, dan ekspresi.

Kawasan Penting

Genomik: Projek penjujukan genom seperti Projek Genom Manusia adalah bidang genomik yang penting.

Proteomik: Perkembangan pangkalan data Proteome seperti SWISS-2DPAGE dan pengembangan perisian untuk reka bentuk ubat berbantukan komputer adalah bidang penting dalam proteomik.

Kesimpulannya

Genomik dan proteomik adalah dua bidang saintifik yang digunakan dalam kajian organisma. Genomik adalah kajian keseluruhan kumpulan gen dalam organisma sedangkan proteomik adalah kajian keseluruhan kumpulan protein yang dihasilkan oleh sel. Perbezaan utama antara genomik dan proteomik adalah kriteria setiap bidang semasa kajian organisma.

Rujukan:

1. Griffiths, Anthony JF. "Genomik: gambaran keseluruhan." Pengenalan Analisis Genetik. Edisi ke-7, Perpustakaan Perubatan Nasional A.S., 1 Januari 1970, Terdapat di sini. Tanpa had. "Genomik dan Proteomik." Genomik dan Proteomik | Biologi Tanpa Batas, Terdapat di sini.3. Graves, Paul R., dan Timothy A. J. Haystead. "Panduan Ahli Biologi Molekul untuk Proteomik." Ulasan Mikrobiologi dan Biologi Molekul, Persatuan Mikrobiologi Amerika, Mac 2002, Terdapat di sini.

Gambar Kesopanan:

1. "Urutan senapang alam sekitar" Oleh John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg - (CC BY 2.5) melalui Wikimedia Commons2. "Proteomics" Oleh Xxl7441 di Wikibooks Inggeris - Dipindahkan dari en.wikibooks ke Commons. (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons