The perbezaan utama antara hibridisasi koloni dan plak adalah bahawa hibridisasi koloni adalah kaedah yang digunakan dalam pemilihan koloni bakteria dengan gen yang diinginkan sedangkan hibridisasi plak adalah kaedah pemilihan fasa dengan gen yang diinginkan. Tambahan pula, hibridisasi koloni dapat digunakan dalam penyaringan perpustakaan berdasarkan plasmid - atau kosmid sementara hibridisasi plak dapat digunakan dalam penyaringan perpustakaan phage.

Hibridisasi koloni dan plak adalah dua teknik yang digunakan dalam pemeriksaan perpustakaan genom atau cDNA. Mereka juga dipanggil lif koloni dan angkat plak masing-masing.

Koloni, Hibridisasi Koloni, Pemeriksaan Perpustakaan, Plak, Hibridisasi Plak

Apa itu Hibridisasi Koloni

Hibridisasi koloni adalah kaedah penyaringan yang digunakan dalam pemilihan koloni bakteria dengan urutan DNA yang diinginkan. Ia juga disebut hibridisasi kotoran koloni, peningkatan koloni atau penyaduran replika. Ia membolehkan penyaringan tanah jajahan dengan kepadatan tinggi. Prosedur asal hibridisasi koloni pertama kali dikembangkan oleh Grunstein dan Hogness. Pertama, koloni bakteria dapat ditransformasikan ke membran dan koloni bakteria dilenyapkan, mendedahkan asid nukleik. Kemudian, asid nukleik yang terdedah dilekatkan ke membran dengan mendenaturasinya dan dihibridisasi dengan probe radioaktif.

Gambar 1: Kaedah Hibridisasi Koloni

Koloni adalah sekumpulan bakteria yang dikembangkan dari sel bakteria tunggal melalui pembiakan aseksual. Oleh itu, semua sel bakteria di koloni tertentu mempunyai susunan genetik yang sama dengan bahan genetik yang diubah. Secara amnya, bakteria diubah dengan bantuan vektor plasmid atau kosmid.

Apa itu Hibridisasi Plak

Hibridisasi plak adalah kaedah penyaringan fag rekombinan. Ini adalah pengubahsuaian hibridisasi koloni oleh Benton dan Devis pada tahun 1977. Kaedah ini juga disebut angkat plak. Prosedur hibridisasi plak serupa dengan prosedur hibridisasi koloni dan plak diangkat dengan menghubungi mereka ke membran nitroselulosa. Asid nukleik kemudiannya terdedah dan terpaku pada membran, hibridisasi dengan prob yang diinginkan.

Gambar 2: Plak di Plat Agar

Plak adalah zon yang jelas pada plat agar yang dihasilkan oleh bakteriofag tertentu dengan lisis sel bakteria di kawasan itu. Kerana jumlah DNA yang lebih sedikit yang dipindahkan ke membran nitroselulosa, hibridisasi plak menghasilkan lebih sedikit isyarat latar belakang.

Persamaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak

Perbezaan Antara Hibridisasi Koloni dan Plak

Definisi

Hibridisasi koloni merujuk kepada kaedah memilih koloni bakteria dengan gen yang diinginkan sementara hibridisasi plak merujuk kepada kaedah penyaringan yang digunakan dalam mengenal pasti fag rekombinan.

Dibangunkan oleh

Hibridisasi koloni pertama kali dikembangkan oleh Grunstein dan Hogness sementara hibridisasi plak pertama kali dikembangkan oleh Benton dan Devis pada tahun 1977.

Jenis-jenis Perpustakaan

Hibridisasi koloni melibatkan pengenalpastian perpustakaan berasaskan plasmid atau kosmid sementara hibridisasi plak melibatkan pengenalpastian perpustakaan phage.

Bilangan Lif

Koloni boleh diangkat untuk satu masa sementara plak boleh diangkat beberapa kali.

Isyarat Latar Belakang

Kesimpulannya

Hibridisasi koloni adalah kaedah penyaringan koloni bakteria di perpustakaan yang dihasilkan dengan vektor plasmid atau kosmid. Sebaliknya, hibridisasi plak adalah kaedah penyaringan bakteriofag di perpustakaan fage. Perbezaan utama antara hibridisasi koloni dan plak adalah jenis perpustakaan yang disaring dalam setiap kaedah.

Rujukan:

1. Kaksonen, Anna. "Pendekatan Molekul untuk Analisis Komuniti Mikroba." Leaching - BioMineWiki, 20 Apr 2006, Terdapat di sini2. Dale, J W, dan P J Greenaway. "Pengenalpastian Fasa Rekombinan oleh Hibridisasi Plak." Kaedah dalam Molekul Biologi (Clifton, N.J.)., Perpustakaan Perubatan Nasional A.S., Terdapat di sini

Gambar Kesopanan:

1. "Hibridisasi Blot" Oleh Kaksonen - http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons 2. "M. smegmatis plak ”Oleh Wazzzup7up - Karya sendiri (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons