Perbezaan Utama - Hela Alpha dan Lembaran Lipatan Beta

Plat alpha helix dan beta adalah dua struktur protein sekunder yang berbeza. Hela alfa adalah konformasi berpusing tangan kanan atau lingkaran dari rantai polipeptida. Dalam heliks alpha, setiap kumpulan N-H tulang belakang menyumbangkan ikatan hidrogen ke kumpulan C = O tulang belakang, yang ditempatkan dalam empat residu sebelumnya. Di sini, ikatan hidrogen muncul dalam rantai polipeptida untuk membuat struktur heliks. Lembaran beta terdiri daripada helai beta yang dihubungkan secara lateral oleh sekurang-kurangnya dua atau tiga ikatan hidrogen tulang belakang; mereka membentuk kepingan lipit yang biasanya dipintal. Berbeza dengan heliks alpha, ikatan hidrogen dalam kepingan beta terbentuk di antara kumpulan N-H di tulang belakang satu helai dan kumpulan C = O di tulang belakang untaian bersebelahan. Ini adalah perbezaan utama antara Alpha Helix dan Beta Pleated Sheet.

Apa itu Alpha Helix

Protein terdiri daripada rantai polipeptida, dan ia dibahagikan kepada beberapa kategori seperti primer, sekunder, tersier, dan kuarter, bergantung pada bentuk lipatan rantai polipeptida. helaian α-heliks dan beta-lipit adalah dua struktur sekunder rantai polipeptida yang paling kerap dijumpai.

Struktur protein alfa-heliks terbentuk kerana ikatan hidrogen antara kumpulan tulang belakang amida dan karbonilnya. Ini adalah gegelung tangan kanan, yang biasanya mengandungi 4 hingga 40 sisa asid amino dalam rantai polipeptida. Gambar berikut menggambarkan struktur heliks alpha.

Ikatan hidrogen terbentuk antara kumpulan N-H satu residu amino dengan kumpulan C = O asid amino yang lain, yang diletakkan dalam 4 residu lebih awal. Ikatan hidrogen ini penting untuk mewujudkan struktur heliks alfa, dan setiap putaran heliks lengkap mempunyai 3.6 residu amino.

Asid amino yang kumpulan Rnya terlalu besar (iaitu triptofan, tirosin) atau terlalu kecil (iaitu glisin) menstabilkan α-heliks. Proline juga menstabilkan α-heliks kerana geometri yang tidak teratur; kumpulan Rnya kembali ke nitrogen kumpulan amida, dan menyebabkan halangan sterik. Selain itu, kekurangan hidrogen pada nitrogen Proline menghalangnya daripada mengambil bahagian dalam ikatan hidrogen. Selain itu, kestabilan heliks alfa bergantung pada momen dipol dari keseluruhan heliks, yang disebabkan oleh dipol individu kumpulan C = O yang terlibat dalam ikatan hidrogen. Heliks α yang stabil biasanya diakhiri dengan asid amino yang dicas untuk meneutralkan momen dipol.

Molekul Hemoglobin, yang mempunyai empat subunit pengikat heme, masing-masing terbuat dari α-heliks.

Apa itu Lembaran Bleated Peta

Lembaran beta lipit adalah jenis struktur sekunder protein yang lain. Lembaran beta terdiri daripada helai beta yang disambungkan secara lateral oleh sekurang-kurangnya dua atau tiga ikatan hidrogen tulang belakang, membentuk kepingan lipit umumnya. Secara amnya, helai beta mengandungi 3 hingga 10 sisa asid amino, dan helai ini disusun berdekatan dengan helai beta lain sambil membentuk rangkaian ikatan hidrogen yang luas. Di sini, kumpulan N-H di tulang belakang satu helai membuat ikatan hidrogen dengan kumpulan C = O di tulang belakang untaian bersebelahan. Dua hujung rantai peptida dapat ditugaskan ke terminal N dan terminal C untuk menggambarkan arahnya. N-terminal menunjukkan satu hujung rantai peptida, di mana kumpulan amina percuma tersedia. Begitu juga, terminal C- mewakili terminal lain dari rantai peptida, di mana kumpulan karboksilik tersedia.

Helai β bersebelahan dapat membentuk ikatan hidrogen dalam susunan antiparalel, selari, atau campuran. Dalam susunan anti-selari, N-terminal satu pendirian bersebelahan dengan terminal-C dari pendirian seterusnya. Dalam susunan selari, ujung N- helai bersebelahan berorientasi pada arah yang sama. Gambar berikut menggambarkan struktur dan corak ikatan hidrogen bagi helai beta selari dan anti-selari.

a) anti parallelb) selari

Perbezaan Antara Hela Alpha dan Lembaran Lipatan Beta

Bentuk

Helix Alpha: Alpha Helix adalah struktur seperti batang bergelung tangan kanan.

Lembaran Lipatan Beta: Lembaran beta adalah struktur seperti helaian.

Pembentukan

Helix Alpha: Ikatan hidrogen terbentuk dalam rantai polipeptida untuk membuat struktur heliks.

Lembaran Bleated Peta: Lembaran beta dibentuk dengan menghubungkan dua atau lebih helai beta dengan ikatan H.

Bon

Helix Alpha: Heliks Alpha mempunyai skema ikatan H + 4. Ikatan hidrogen terbentuk antara kumpulan N-H satu residu amino dengan kumpulan C = O asid amino lain, yang diletakkan dalam 4 residu lebih awal.

Lembaran Lipatan Beta: Ikatan hidrogen terbentuk di antara kumpulan N-H dan C = O yang berdekatan dengan rantai peptida bersebelahan.

-R kumpulan

Helix Alpha: -R kumpulan asid amino berorientasikan di luar heliks.

Lembaran Bleated Peta: -R kumpulan diarahkan ke dalam dan di luar helaian.

Nombor

Helix Alpha: Ini boleh menjadi rantai tunggal.

Lembaran Bleated Peta: Ini tidak boleh wujud sebagai helai beta tunggal; mesti ada dua atau lebih.

Jenis

Helix Alpha: Ini hanya mempunyai satu jenis.

Lembaran Bleated Peta: Ini boleh selari, anti selari atau bercampur.

Kualiti

Helix Alpha: 100^o putaran, 3.6 baki per giliran dan 1.5 A^o naik dari satu karbon alpha ke yang kedua

Lembaran Bleated Peta: 3.5 A^o kenaikan antara residu

Asid amino

Helix Alpha: Hela Alpha lebih suka rantai sisi asid amino, yang dapat menutup dan melindungi ikatan H tulang belakang di teras heliks.Lembaran Lipatan Beta: Struktur yang diperpanjang meninggalkan ruang maksimum untuk rantai sisi asid amino. Oleh itu, asid amino dengan rantai sisi besar besar lebih suka struktur kepingan beta.

Pilihan

Helix Alpha: Hela Alpha lebih suka asid amino Ala, Leu, Met, Phe, Glu, Gln, His, Lys, Arg.

Lembaran Bleated Peta: Lembaran beta lebih suka Tyr, Trp, (Phe, Met), Ile, Val, Thr, Cys.

Gambar Kesopanan:

"Struktur Protein Alpha Helix" [Domain Awam] melalui Wikimedia Commons

"Molekul Hempglobin" Oleh Zephyris di Wikipedia bahasa Inggeris (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons

"Parellel and Antiparellel" oleh Fvasconcellos - Karya sendiri. Dibuat oleh pemuat naik atas permintaan oleh Opabinia regalis., (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons