The perbezaan utama antara exome dan transcriptome adalah bahawa exome adalah urutan lengkap dari semua ekson dalam gen pengekodan protein dalam genom sedangkan transkriptom adalah pengumpulan molekul RNA messenger yang berasal dari gen pengekodan protein. Selanjutnya, exome merangkumi 1-2% dari keseluruhan urutan genom sementara transkripom merangkumi kurang dari 4% dari jumlah RNA sel.

Exome dan transcriptome adalah dua koleksi urutan dalam gen pengekodan protein dalam genom. Kedua-duanya mempunyai pelbagai aplikasi dalam kajian genomik dan juga diagnosis penyakit.

Kawasan Utama Dilindungi

1. Apa itu Exome - Definisi, Fakta, Teknik 2. Apa itu Transkripome - Definisi, Fakta, Teknik 3. Apakah Persamaan Antara Exome dan Transkripome - Garis Besar Ciri Umum 4. Apakah Perbezaan Antara Exome dan Transkripome - Perbandingan Perbezaan Utama

Syarat Utama

Exon, Exome, mRNA, Gen Protein-Coding, Transcriptome

Apa itu Exome

Exome adalah kumpulan ekson dalam gen pengekodan protein genom organisma tertentu. Urutan pengekodan genom dikelompokkan menjadi gen, yang boleh dikodkan untuk protein atau RNA. Dalam genom prokariotik, urutan pengekodan tidak terganggu oleh urutan lain sementara di genom eukariotik, urutan pengekodan gen terganggu oleh urutan bukan pengekodan yang disebut intron. Oleh itu, urutan pengkodan berkelompok disebut ekson.

Gambar 1: Exon dan Intron

Dalam gen pengekod protein, polimerase RNA mentranskripsikan intron dan ekson ke mRNA pendahulu semasa transkripsi. Intron yang digabungkan dikeluarkan semasa pengubahsuaian pasca transkripsi berikut. Teknologi utama yang digunakan dalam kajian exome adalah penjujukan keseluruhan-eksome (WES). WES terlibat dalam hibridisasi DNA terpecah dari genom tertentu untuk mengenal pasti urutan DNA sasaran diikuti dengan penjujukan.

Apa itu Transkripome

Transkripome adalah sekumpulan mRNA yang dinyatakan dalam sel. Ia menyumbang kurang dari 4% daripada jumlah RNA sel. Oleh kerana transkripome menentukan komposisi proteome, ia menentukan keupayaan biokimia sel tersebut. Juga, transkrip sel tertentu tidak dapat disintesis dan selalu datang ke sel anak perempuan dari sel induk semasa pembahagian sel. Oleh itu, transkripsi, yang merupakan proses menghasilkan RNA adalah langkah untuk pemeliharaan transkripome.

Gambar 2: Transkripome Pluripotent Cell

Sebaliknya, walaupun setiap sel berisi maklumat untuk pengeluaran keseluruhan transkripom spesies, gen yang dinyatakan dalam sel bergantung pada faktor persekitaran juga. Dua teknologi utama yang digunakan dalam kajian transkriptom adalah microarray dan RNA-seq.

Persamaan Antara Exome dan Transkripome

Perbezaan Antara Exome dan Transkripome

Definisi

Exome merujuk kepada bahagian genom yang terdiri daripada ekson, yang menyusun maklumat untuk sintesis protein sementara transkripome merujuk kepada jumlah keseluruhan semua molekul RNA utusan yang dinyatakan dalam gen organisma. Perbezaan utama antara exome dan transcriptome adalah jelas dari definisi ini.

Kepentingan

Oleh itu, exome adalah jumlah set ekson dalam gen pengekod protein sementara transkripome adalah set keseluruhan mRNA yang dinyatakan dalam sel.

DNA atau RNA

Juga, exome terdiri dari DNA sementara transkripome terdiri dari RNA.

Jumlah

Exome mewakili 1-2% dari jumlah genom sementara transkripom mewakili kurang dari 4% dari jumlah RNA sel.

Tahap

Perbezaan lain antara exome dan transcriptome adalah bahawa exome berada di tahap genomik sedangkan transkripome berada di tahap transkripsi.

Teknik

Selanjutnya, penjujukan keseluruhan-exome adalah teknik untuk menentukan exome manakala microarray dan RNA-seq menentukan transkripom.

Kesimpulannya

Exome adalah keseluruhan set ekson dalam genom yang ditentukan oleh WES genom. Oleh itu, exome adalah konsep berasaskan DNA. Tetapi, transkripome adalah konsep berdasarkan RNA kerana ia adalah keseluruhan rangkaian mRNA sel. Perbezaan utama antara exome dan transcriptome adalah konsep mereka.

Rujukan:

1. Warr, Amanda et al. "Urutan Exome: Perspektif Semasa dan Masa Depan." G3: Gen | Genom | Genetik 5.8 (2015): 1543–1550. PMC. Web. 6 Sept 2018. Terdapat Di Sini2. TA coklat. Genom. Edisi ke-2. Oxford: Wiley-Liss; 2002. Bab 3, Transkrip dan Proteom. Terdapat di sini

Gambar Kesopanan:

1. "DNA ekson intron" Oleh Institut Penyelidikan Genom Manusia Nasional - (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons 2. "Transkrip sel pluripoten" Oleh Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., The transcriptome pluripoten (10 Oktober, 2008), StemBook, ed. Komuniti Penyelidikan Stem Cell, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Rajah 2 Transkrip sel pluripoten. Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., The transcriptome pluripoten (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komuniti Penyelidikan Stem Cell, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. (CC BY 3.0) melalui Wikimedia Commons